Consecuencias genómicas de la endogamia intensiva en una población aislada de lobos

RESUMEN

La endogamia (apareamiento entre individuos emparentados) es una prioridad para la conservación, ya que disminuye la condición física individual y puede aumentar el riesgo de extinción de una población. Los autores emplearon la resecuenciación de todo el genoma de 97 lobos (Canis lupus) de la población de lobos escandinavos con elevados niveles de consanguinidad para identificar segmentos de cromosomas «idénticos por descendencia» (del inglés identical-by-descent) (IBD) como rachas de homocigosidad (ROH). Esto dio la alta resolución requerida para medir con precisión la consanguinidad realizada como la fracción IBD del genoma en ROH (F-ROH). Encontraron un patrón sorprendente de homocigosidad completa o casi completa de cromosomas enteros en muchos individuos. La mayoría de la endogamia individual se debió a segmentos IBD largos (> 5 cM) originados de ancestros < = 10 generaciones atrás, con 10 regiones genómicas que muestran muy pocas ROH y que forman regiones candidatas para contener loci que contribuyen fuertemente a la depresión por endogamia. La consanguinidad estimada con un pedigrí extenso (F-P) se correlacionó fuertemente con la consanguinidad realizada medida con el genoma completo (r (2) = 0,86). Sin embargo, la endogamia medida con todo el genoma se correlacionó más fuertemente con la heterocigosidad multilocal estimada con tan solo 500 polimorfismos de un sólo nucleótido, y con F-ROH estimada con tan solo 10 000 polimorfismos de un sólo nucleótido, que con F-P. Estos resultados documentan en detalle las consecuencias genómicas de la consanguinidad intensiva en una población de interés para la conservación.

Los autores y otros datos del artículo:

Kardos, M., M. Akesson, T. Fountain, O. Flagstad, O. Liberg, P. Olason, H. Sand, P. Wabakken, C. Wikenros and H. Ellegren (2018). «Genomic consequences of intensive inbreeding in an isolated wolf population”. Nature Ecology & Evolution 2 (1): 124-131.

La revista Nature Ecology & Evolution se clasificó de la siguiente manera en el año 2017 (Web of Science, 2019):

Categoría de la revista

Total de revistas Clasificación de la revista Cuartil

Ecología

160 160

Q4

Biología Evolutiva 49 49

Q4

REFERENCIAS

Web of Science (2019). Consultado el 9 de Junio de 2019. https://apps.webofknowledge.com/full_record.do?product=WOS&search_mode=GeneralSearch&qid=1&SID=F4dLNdxQlWMFrRuaeds&page=1&doc=1

 

 

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