RESUMEN
Varios procesos, como la evolución fenotípica, la susceptibilidad a las enfermedades y las adaptaciones ambientales, que dan forma a la domesticación de los animales, son en gran parte atribuibles a las variaciones estructurales (SV) en el genoma. En este estudio, los autores muestran genomas de alta calidad del lobo (Canis lupus) y cuón (Cuon alpinus) con andamio N50 de 6,4 Mb y 3,96 Mb, respectivamente. La alineación de secuencias que comprende genomas de tres especies de cánidos revela SV específicas para el perro, particularmente 16 315 inserciones, 2565 deleciones, 443 repeticiones, 16 inversiones y 15 translocaciones. La anotación funcional de las SV de perro asociadas con genes indica sus enriquecimientos en metabolismos energéticos, procesos neurológicos y sistemas inmunes. Curiosamente, identificaron y verificaron a nivel de población una inserción que cubre completamente una copia de la transcripción de AKR1B1 (Aldo-Keto Reductasa Familia 1 Miembro B). El análisis de transcriptoma revela un alto nivel de expresión de la nueva copia AKR1B1 en el intestino delgado y el hígado, lo que implica un aumento en la síntesis de novo de ácidos grasos y la capacidad antioxidante en el perro en comparación con el lobo, probablemente en respuesta a cambios en la dieta durante la revolución agrícola. Por primera vez, se aporta información de un análisis exhaustivo de la dinámica evolutiva de SV durante el paso de domesticación de perros. Estos hallazgos demuestran que la retroposición puede generar nuevos genes para facilitar la domesticación, y afirman la importancia de las variantes genómicas a gran escala en los estudios de domesticación.
Los autores y otros datos del artículo:
Wang, W. M. Zhao, B. Zhang, J. Ruan and Y. P. Zhang (2019). «Structural variation during dog domestication: insights from gray wolf and dhole genomes”. National Science Review 6 (1): 110-122.
La revista National Science Review tuvo un factor de impacto en el año 2018 de 13,222 (Web of Science, 2020).
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Categoría de la revista |
Total de revistas | Clasificación de la revista | Cuartil |
| Ciencias multidisciplinares | 69 | 3 |
Q1 |
REFERENCIAS
Web of Science (2020). Consultado el 15 de Mayo de 2020. https://apps.webofknowledge.com/Search.do?product=WOS&SID=F1APnN3kCd2pomJugQZ&search_mode=GeneralSearch&prID=c8745477-8381-49f3-b6ac-85e1e8fa3d54